原始资料的配对卡方检验(Paired χ² Test)——MedCalc软件实现

发布于 2022年8月11日 星期四 09:49:02 浏览:1396
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在前面文章中介绍了配对χ²检验(Paired χ² Test)的假设检验理论,本篇文章将实例演示在MedCalc软件中实现原始资料的配对χ²检验的操作步骤。

关键词:MedCalc; 配对四格表; 配对卡方检验; McNemar检验

一、案例介绍

某实验室分别用A方法和B方法对600例患者血清中某抗体进行测定,问两种方法的检测结果有无差别?

首先进行数据录入,χ²检验的数据录入可分为两种:第一种为频数资料,需设置分组变量、观察变量和频数变量;第二种为非频数资料(原始资料),设置分组变量和观察变量即可,每一行为一个患者的数据。本案例的数据采用了第2种录入方式。部分数据见图1。ID表示检测样本编号,A、B分别表示A方法和B方法,1表示检测结果阳性,2表示检测结果阴性。本文案例数据可从“附件下载”处下载。

图1

二、问题分析

本案例的分析目的是比较两种方法的检测结果有无差别,属于配对设计,可以认为是在比较两种方法检测结果的一致性,或者比较两者阳性检测率的差异。每个数字代表的是一个对子,而不是单独的一个频数。对于本案例可采用2×2配对χ2检验(McNemar Test)进行分析。但需要满足3个条件:

条件1:观察变量为二分类变量。本案例数据为检测结果的阴性和阳性,满足该条件。

条件2:试验方法或干预措施为两个。本案例为A和B两种检测方法,满足该条件。

条件3:研究设计为配对设计,即对同一批样本或研究对象进行两种方法的检测或干预。本案例对同一组患者使用两种抗体检测方法,为配对设计,满足该条件。

三、软件操作及结果解读

(一) 适用条件判断

本案例满足条件1~3。

(二) 统计描述及推断

1. 软件操作

①选择“统计”—“交叉表”,打开“麦内玛检验”对话框(图2)。

图2

②在“麦内玛检验”对话框,“分类X”下选择变量“A”,“分类Y”下选择变量“B”,筛选条件不选择任何变量(图3),点击“确定”

图3

2. 结果解读

(1) 统计描述

图4第二个表格中提供了两种检测方法检测结果的详细情况,可知两种检验方法一致的有440对(同为阳性110对,同为阴性330对),不一致的有160对(A方法为阳性,B方法为阴性130对;A方法阴性,B方法阳性30对)。A方法的阳性率为40%,B方法的阳性率为23.3%。

图4
(2) 统计推断

图4还显示了McNemar检验结果,提供了统计推断后的阳性率差异和95% CI置信区间和显著性(P值)。可知两组阳性率的差值为16.67%,总体阳性率差异的95%CI为(12.76~20.58)%,P<0.0001,按α=0.05水准,可认为差异具有统计学意义,即两种检测方法结果不同。

四、结论

本研究采用2×2配对χ2检验(Paired Samples McNemar Tests)评价A方法和B方法检测患者血清中某抗体阳性率的一致性。结果显示检测不一致的有160对(A方法为阳性,B方法为阴性130对;A方法阴性,B方法阳性30对);配对χ2检验分析发现,两种检测方法结果不同(P<0.0001)。

五、知识小贴士

  • 配对卡方检验一般用于样本含量不太大的资料,因为该法仅考虑了两种检测方法结果不一致的两种情况(bc),而未考虑样本含量n和两种方法结果一致的两种情况(ad)。所以,当n很大且ad的数值很大(即两法的一致率较高),bc的数值相对较小时,即便是检测结果有统计学意义,其实际意义往往也不大。详见为何配对卡方检验结果不那么可信?
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