汇总资料的Cohen's Kappa值——SPSS软件实现

发布于 2022年5月8日 星期日 14:28:00 浏览:6059
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在“无金标准的诊断试验研究——概述”一文中介绍了Cohen's Kappa值常用于二分类资料或无序多分类资料评价一致性。前面文章(诊断试验评价——真实性评价)介绍了Cohen's Kappa值的计算公式。本文进一步详细介绍Cohen's Kappa一致性检验在SPSS软件中的实现过程。

关键词:SPSS; 诊断试验; 分类资料; 金标准; Kappa; 一致性分析

一、二分类资料

(一) 案例介绍

某医生采用A、B两种方法检测新型冠状病毒(SARS-CoV-2)抗体,想评价者两种方法的一致性,其检验结果如下:

表1

(二) 案例分析

本案例是评价两种方法检测结果的一致性,资料类型为二分类资料,可考虑使用Cohen's Kappa一致性检验。

(三) SPSS软件操作

1. 数据输入

将表1内容整理为图1的数据形式,创建代表A方法检测结果的变量“A”,代表B方法检测结果的变量“B”,代表频数的变量“Freq”,其中“0”为阴性结果,“1”为阳性结果。本文案例可从“附件下载”处下载。

图1

2. 数据加权

(1) 选择“数据”—“个案加权”(图2)。

图2

(2) 在“个案加权”对话框中选择“个案加权系数”,将左侧变量“Freq”选入右侧“频率变量”框中,点击“确定”,则完成数据加权(图3)。

图3

3. Kappa一致性检验

(1) 选择“分析”—“描述统计”—“交叉表”(图4)。

图4

(2)出现“交叉表”对话框,将“A”和“B”分别放入右侧“行”和“列”,【行和列中的变量可以互换位置,不影响检验结果】。点击 “交叉表”对话框右侧“统计”(图5)。

图5

(3)在“交叉表:统计”对话框中勾选“Kappa”,然后点击“继续” (图6),回到“交叉表”对话框。

图6

(4)点击图5“交叉表”对话框右侧“单元格”,在“交叉表:单元格显示”对话框中,”计数”下勾选“实测”,在“百分比”下勾选“行”和“列”,然后点击“继续”(图7),回到“交叉表”对话框,点击“确定”,则得到检验结果。

图7

4. 结果解读

(1) 统计描述

图8为数据的基本情况,共有220对有效数据,没有缺失,总数据为220对。

图8

A方法*和B方法交叉表中给出了两种方法检测的构成情况,如图9所示。

图9
(2) 统计推断

由图10的结果可知,A方法与B方法的Kappa值为0.582 (P<0.001),提示两种方法诊断结果具有一致性,参考Kappa的判断标准,可知一致性中等。

图10

SPSS未能直接计算Kappa值的95%置信区间(95%CI),但是给出了Kappa值的渐进性标准误,可计算95%C。本研究Kappa值的渐进性标准误为0.068。因Kappa/ASE近似服从标准正态分布,据此计算出本Kappa 系数的95%CI为:0.582±1.96×0.068=0.582±0.13328,即(0.449,0.715)。

二、无序多分类指标

(一) 案例介绍

两名放射科医生对55名就诊者进行肝癌诊断。判断结果为:1=“不确定”,2=“良性”,3=“恶性”,其判断结果如表2所示:

表2

(二) 案例分析

本案例是评价两种方法检测结果的一致性,资料类型为无序多分类资料,可考虑使用Cohen's Kappa一致性检验。

(三) SPSS软件操作

1. 数据输入

将表2内容整理为图11的数据形式,创建代表A方法检测结果的变量“A”,代表B方法检测结果的变量“B”,代表频数的变量“Freq”,其中1=“不确定”,2=“良性”,3=“恶性”。本文案例可从“附件下载”处下载。

图11

2. 数据分析

参照二分类资料相关操作。

3. 结果解读

由图12的结果可知,医生A与医生B的Kappa值为0.577 (P<0.001),提示两名医师诊断结果具有一致性,参考Kappa的判断标准,可知一致性中等。

图12

三、分析小技巧

在实际研究过程中会遇到很多疾病诊断并无金标准,或金标准难以获得或创伤较大而不能被执行。此时,可以用一致性分析进行评价。Cohen's Kappa一致性检验考虑到机遇因素对一致性的影响,广泛应用于二分类或者无序多分类指标的一致性检验。可根据Kappa值和假设检验,判断两种方法是否存在一致性及一致性程度。

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