生存曲线比较的Log-rank检验——MedCalc软件实现

发布于 2022年7月7日 星期四 11:28:06 浏览:5064
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前面文章中介绍了单样本生存资料的Kaplan-Meier法绘制生存曲线,本文将实例演示在MedCalc软件中实现生存曲线比较的log-rank检验的操作步骤。

关键词:MedCalc;生存分析; Kaplan-Meier; log-rank检验

一、案例介绍

研究人员对20例某肿瘤术后病人(采用甲、乙两种治疗方法)随访5年,记录术后生存时间;试绘制生存曲线,并估计两种疗法的生存曲线有无不同。数据见表1,变量包括组别(Group:1=甲疗法组,2=乙疗法组)、结局(Status:1=死亡,0=删失)、随访时间(Time,月)。案例可从“附件下载”处下载。

表 1

二、案例分析

本案例分析目的是估计两种疗法的生存曲线有无不同,可考虑使用log-rank检验。但需要满足4个条件:

条件1:结局为互斥的二分类变量,即删失和死亡。该条件满足。

条件2:随访时间或生存时间定义明确,并为量化数据,即以天、周、月、年等为单位的具体数值。本案例数据的生存时间为准确可测量的月数,该条件满足。

条件3:不宜有长期变异存在。对于动态队列,研究对象不是同时进入队列的,那么如果后期进入队列的研究对象使用了新的治疗方案和药物,生存率提高,那么整个队列的生存结果就会发生偏倚。该条件需要根据实际情况来判断,这里默认无长期变异。

条件4:删失事件在各组的分布相似。本案例可根据后文结果进行判断。

三、软件操作及结果结果

(一) 软件操作

1. 数据录入

数据录入,可分为直接输入和外部导入。本案例选择从外部导入。

图 1

2. 绘制Kaplan-Meier曲线

(1)择“统计”—“生存分析”—“ Kaplan-Meier生存分析”(图2)

图 2

(2) 打开“Kaplan-Meier生存分析”对话框(图3),各个选项含义参考(单样本生存资料的Kaplan-Meier法)。

  • 生存时间:本例为“Time”
  • 终点:本例为“Status”,状态是默认值
  • 因子:本例为“Group”
  • 筛选条件:未选择任何变量
  • 选项本例默认选项
  • 图表:本例选择“生存概率(%)” “在图表中包含95%CI” “在图表中标记截尾数据” “图表下面风险表格中的数字”

(3) 点击“确定”,得到检验结果

图 3

(二) 结果解读

1. 案例汇总

本研究共随访20例某肿瘤术后病人,其中完全数据12例(60%),删失数据8例(40%)。甲疗法组10人,其中完全数据7例(70%),删失数据3例(30%);乙疗法组10人,其中完全数据5例(50%),删失数据5例(50%)。见图4。

图 4

2. 平均和中位生存期

某肿瘤术后病人的平均生存期为37.303月,总体平均生存期的95%CI为(28.064~46.542)月,中位生存期为42.000月,总体中位生存期的95%CI为(18.000~60.000)月。甲疗法组的平均生存期为31.926月,总体平均生存期的95%CI为(18.290~45.562)月,中位生存期为38.000月,总体中位生存期的95%CI为(9.000~60.000)月。乙疗法组的平均生存期为41.770月,总体平均生存期的95%CI为(30.131~53.409)月,中位生存期为43.000月,总体中位生存期的95%CI为(10.000~50.000)月,见图5。所有结果可根据需要保留相应的有效位数

图 5

3. 生存表

通过生存表可知,某肿瘤术后病人的总的1年、2年、3年、5年生存率分别约为78.9%、67.2%、60.5%和13.0%;甲疗法组的1年、2年、3年、5年生存率分别约为66.7%、55.6%、55.6%、0%;乙疗法组的1年、2年、3年、5年生存率分别约为90.0%、78.7%、63.0%、31.5%。见图6。

图 6

4. log-rank检验结果

Log-rank检验结果为χ²=1.5370,P=0.2151,见图7。按α=0.05水准,拒绝H0,接受H1,即甲乙两种疗法的生存曲线相同。

图 7

5. 风险比(hazard ratio,HR)

风险比类似于logistic回归中优势比OR值。也体现了相对危险度的概念。即同一时点i时,两组对象的结局风险比。Log-rank检验结果为χ²值有统计学意义时,可以观察HR的大小。HR>1,表示暴露于某因素下死亡风险高(即该因素是危险因素);HR<1,表示暴露于某因素下死亡风险低(即该因素是保护因素)。当HR的95%CI不包含1时,表示HR与1的差异有统计学意义,包含1时,表示HR与1的差异无统计学意义。甲疗法组与乙疗法组相比,HR=2.1066,95%CI为0.6487~6.8413(乙疗法组与甲疗法组相比,HR=0.4747,95%CI为0.1462~1.5416,不影响统计学推断),见图8。两组发生死亡风险的差异无统计学意义,与log-rank检验结果相一致。

图 8

6. 生存曲线

生存曲线上的小垂直线表示删失数据,生存图下方的表格为对应时间的期初暴露人数,生存曲线见图9。根据图9中风险数字可知,该数据满足条件4。结合图5、图7结果,可知乙疗法组生存曲线高于甲疗法组,但两者差异没有统计学意义。

图 9

四、结论

本研究采用Kaplan-Meier曲线法绘制生存曲线,并采用log-rank法对不同方法治疗某肿瘤患者的生存结果进行比较。甲、乙疗法组的中位生存期分别为38.0 (95%CI为9.0~60.0)月和43.0 (95%CI为10.0~50.0)月,乙方法高于甲方法,但log-rank检验结果表明两种方法治疗的肿瘤患者生存分布比较,差异无统计学意义(χ2=1.537,P=0.2151)。

五、知识小贴士

(一) 删失数据

在规定的随访期内,未能观察到一些研究对象结局事件的发生,即不能得知结局事件确切的发生时间,称这类研究对象的随访时间/生存时间为删失数据。根据原因可分为3种类型:

(1)研究结束时(已达到规定的最长观察期/随访期),研究对象仍未出现结局事件;

(2)由于研究对象在研究期间不再继续就诊,或拒绝访视,或失去联系等,未能观察到结局事件;

(3)研究对象出现了竞争事件(如其他原因的死亡),观察不到既定的结局事件而终止随访。

(二) 中位生存时间

中位生存时间表示累积生存率为50%所对应的时间,是生存分析中最常用的描述性统计量。生存分析中较少使用平均生存时间。

(三) Log-rank检验

Log-rank检验中的“log”并非为“对数”,而是表示“count”、“register”或“record”。在中文描述中可以直接写为“log-rank检验”,或者译为“时序检验”。

Log-rank检验是比较不同组患者生存曲线的非参数检验,属于单因素分析。若想校正其他因素则需要采用Cox比例风险模型进行分析。

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