GraphPad Prism XY表图形绘制——模拟直方图

发布于 2022年4月22日 星期五 16:51:21 浏览:6087
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直方图(histogram)又称频数分布图,横轴尺度表示数值型变量,纵轴是频数或频率,常用来描述连续型随机变量的频数分布或频率分布,从图形中可直观的反应数据分布的特点。本文实例介绍在GraphPad Prism中绘制模拟直方图的步骤。

关键词: GraphPad Prism; XY表; 直方图

当分析一组数据时,常常希望可以简便地了解这组数据的分布特点,比如不同区间组出现的频数多少。为了达到这一目的,可以绘制频数的分布(即直方图),从图形中更直观的反应数据分布的特点。直方图 (histogram)的横轴尺度表示数值型变量,纵轴是频数或频率,常用来描述连续型随机变量的频数分布或频率分布。不同于直条图 (bar graph,又称柱状图),是用相等宽度直条的长短来表示所比较指标的数值大小和它们之间的对比关系,常用来比较独立的或离散变量的统计图。

一、案例介绍

在某单位参加体检的员工中随机抽取200名员工的血液检查结果,其中男性116名,女性84名,探讨该单位不同性别员工的低密度脂蛋白(LDL-C)水平。该数据包括这200名员工的低密度脂蛋白水平的组段、男性和女性员工在某一区间的频数。数据见图1,本文案例可从“附件下载”处下载。

图1

二、问题分析

本案例的分析目的是分别描述116名男性员工和86名女性员工的血清低密度脂蛋白的水平,已知不同性别在各个水平区间的频数,可以绘制直方图观察分布特征。

三、软件操作及结果解读

(一) 数据读取

1. 直接录入

打开GraphPad Prism,在弹出的欢迎界面中,Data table (数据表)选择Enter or import data into a new table (在新的数据表中写入数据),在Options (选项)中,X选择Numbers (数字),Y选择Enter and plot a single Y value for each point (即每一行只输入一个Y值),单击create创建数据表,如图2所示。

图2

在建立的工作区中,用户可以自己手动输入数据 (图3)。X列为200名员工的低密度脂蛋白 (LDL-C)的含量组段 (mmol/L),Y列为该区间的频数。

图3

2. 导入数据

用户也可以导入已有的数据,具体过程如下:

(1) 点击上方工具栏file (文件)中的import (导入)选项 (图4)

图4

(2) 在弹出的对话框的右下角先选择需要导入的数据存放格式 (图5),然后选择用户的目标文件,单击OK

图5

(3) 在随后弹出的对话框Import and Paste Special Choice (导入并粘贴特殊选项,图6)的Linking and embedding (联系和嵌入)中选择Insert data only (仅插入数据)

(4) 点击Import即可导入数据

图6

将数据表重命名为“员工低密度脂蛋白水平分布情况” (图7),对数据命名有助于日后的文件管理。如有需要,用户可以在Info部分对实验时间、实验编号和项目名称等进行简单描述,或者单击工具栏Sheet选项中的图标,可以在各表单上添加悬浮笔记,记录需要的信息。

图7

(二) 图形绘制

点击左侧导航栏中的Graphs (图片)下属的New Graph…(绘制新图),在弹出的Great New Graph (绘制新图)对话框中的Kind of Graph (图形种类)下选择XY图下的柱状图,单击OK (图8),结果如图9所示。

图8
图9

单击选中图形中的标题、图例等,利用上方的Text工具栏可以对其字体、字号等进行修改 (图10)。

图10

(三) 图形美化

1. 图形绘制区的美化

(1) 颜色设置

① 在工具栏Change栏中,单击图标或者双击图形绘制区,就可以进入Format Graph (图表样式)界面的Appearance (外观)选项卡中

② 在Data set下拉列表中可以选择要设置的数据组,如本例中可以分别设置“员工低密度脂蛋白水平分布情况:A:男性”或“员工低密度脂蛋白水平分布情况:B:女性”, 也可以选择“---Change All data sets--- (同时设置所有的数据组)”

③ 勾选Show bars/spikes/droplines (显示条/峰/支线)复选框以显示图表中的符号,并单击Color属性的下拉按钮,进入取色面板

④ 设置颜色为半透明色,也可单击取色面板底部的More color& transparency (更多颜色&透明度),可以选择更多颜色和调整图标透明度(图11)

图11

⑤ 单击Add to Custom Colors (添加到自定义颜色)按钮,可以将定义好的颜色添加到左下角的Custom (自定义)中

⑥ 选中该自定义颜色,单击OK即可设定颜色(图12)

图12
(2) 形状设置

① 在上一步单击OK后,回到Appearance (外观)选项卡中,设置直条矩形的宽度 (Width)很重要,需要与X轴的长度相配合,目的是使相邻两直条之间没有间隙,可以选择较宽的宽度,这里选择9号大小。

② 直条矩形可以加边框,也可以不加。如需要,可以设置Border color (边框颜色)和Border thickness (边框粗细, 图13)。

图13

2. 图形坐标轴的美化

(1) 整体框架的设置

① 单击工具栏Change栏中的图标或双击坐标轴进入Format Axes (坐标轴格式)界面

② 在Frame and Origin (框架与起始)页面下,Shape, Size and Position (形状、尺寸和位置)中可以对图标的X轴和Y轴的长短进行定义,还可以调整X轴和Y轴与边缘的距离。本例中将Width (宽度)和Height (高度)分别设置为6.30 cm、5.50 cm。其目的为了配合直条宽度为9号而设置的,实际应用时需要多次调试,以找到合理的尺寸(图14)

③ 在Axes and Colors (轴线与颜色)下可以对X轴和Y轴的粗细、颜色进行调整

图14
(2) X、Y轴设置

先设置X轴:

① 单击Format Axes (坐标轴格式)中的X axis (X轴)选项,进入X坐标轴的设置

② 取消勾选Automatically determine the range and interval (默认的范围和间距),便可以对X坐标轴进行编辑

③ 在Range (范围)下可以设置X轴的范围,这里选择0-7的范围

④ 在All ticks (所有刻度线)中,通过Tick direction (刻度线方向)下拉选项,选择刻度朝向;通过Tick length (刻度线长度)选择刻度线长度

⑤ 在Regularly spaced ticks (常用间隔刻度线)中,Major ticks (主刻度线)可以设置主要刻度间隔,Minor ticks (次刻度线)可以设置次要刻度的间隔(图15)

完成对X轴的设置后,可同样的方法设置Y轴。

本例的最终结果图形见图16。

图15
图16

其他更多设置,可以根据需要在相应部分进行操作。

End
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