GraphPad Prism 纵列表 (Column)图形绘制——森林图的绘制

发布于 2023年3月3日星期五 21:24:35 浏览：9871

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森林图.zip 请勿重复点击，如无响应请耐心等待或稍后再试。

森林图 (Forest Plot)是一种以图形的外观来命名的图形，也被称之为比值图 (Odds Ratio Plot)。森林图在医学研究中作为一种可视化图形十分常见，除了用于Meta分析以外，还用于回归分析、Cox分析中效应值及其置信区间的结果可视化。本文实例介绍在GraphPad Prism中绘制森林图的步骤。

关键词: GraphPad Prism; 纵列表; 森林图

森林图是以一条垂直于横轴，且坐标刻度为1或0的无效线为中心，用点或其他形状来表示每个被纳入变量效应值的点估计值，用平行于横轴的多条线描述效应值的置信区间。再加上变量名、假设检验的P值等信息绘制成图，可更加简单直观的为读者展示分析结果。

一、案例介绍

图1数据为二分类logistic回归分析(Binomial Logistic Regression Analysis)——Stata软件实现 (链接)中多因素回归分析的结果，变量Age (年龄：1=小于60岁、2=大于或等于60岁)、Parts [部位：1=单侧、2=center(中央)、3=lateral(极外侧)]、Calcification (钙化)、Sagittal diameter (矢状径)、Degeneration grade (退变级别：1=Ⅰ~Ⅲ、2=Ⅳ、3=Ⅴ)。将OR值、OR的95%CI (95%置信区间)下限和上限值在Excel中转置为图2的样式，然后进行森林图的绘制。本案例数据可从 “附件下载”处下载。

二、问题分析

本案例的目的是将回归分析的主要结果转化为森林图，绘制森林图主要需要变量名、效应值(回归系数/OR/RR/HR)及其置信区间。其他的结果如P值可以在森林图中以文本形式插入。

三、软件操作及结果解读

(一) 数据读取

1. 直接录入

打开GraphPad Prism，在弹出的欢迎界面中，选择左侧New table & graph (新建图表)中的Column (纵列表)，Data table (数据表)选择Enter or import data into a new table (在新的数据表中写入数据)，在Options (选项)中，选择Enter replicate values, stacked into columns (输入复制值，叠加成列)单击create创建数据表，见图3。

在每一列Group下分别输入变量名和相应的OR值、OR值的95%置信区间的下限和上限 (图4)。

2. 外部导入

用户也可以导入已有的数据，具体过程如下：

(1) 点击上方工具栏file(文件)中的import(导入)选项 (图5)

(2) 在弹出的对话框的右下角先选择需要导入的数据存放格式 (图6)，然后选择用户的目标文件，单击OK

(3) 在随后弹出的对话框Import and Paste Special Choice (导入并粘贴特殊选项，图7)的Linking and embedding (联系和嵌入)中选择Insert data only (仅插入数据)

(4) 点击Import(导入)即可导入数据

如有需要，用户可以在Info部分对实验时间、实验编号和项目名称等进行简单描述，或者单击工具栏Sheet选项中的图标，可以在各表单上添加悬浮笔记，记录需要的信息 (图8)。

(二) 图形绘制

① 点击左侧导航栏中的Graphs部分下属图片文件，弹出Change Graph Type对话框，选择Mean/median & error (均数/中位数和标准差)下的森林图，Plot: (图形绘制方式)选择Median with range (带极差的中位数)，软件会自动找出每列3个数据中的最小值、最大值和中位数，随后单击OK (图9)，结果见图10。

② 单击选中图形中的标题、图例等，利用上方的Text工具栏可以对其字体、字号等进行修改 (图11)。

③ 图形字体修改好后，在工具栏中的Change (变换)选项组中单击图标按钮 (图12)，选择Reverse order of data sets (front-to-back or right-to-left) (转变数据集顺序，前变后或右变左)命令，将数据集代表的图形顺序颠倒，目的是为了与图2的表格顺序一致，颠倒后图形见图13。

④ 在图形绘制区的空白处右击，在弹出的菜单中选择Insert Object (插入对象)命令，然后选择Excel Object (Excel表格对象)命令，见图14。然后在弹出的excel表格中输入和图2一致的表格。由于该表格会按原样添加到GraphPad Prism的图形中，所以一定要在excel表格中设置好字体、字号、格式、线条等，隐去excel表格的网格线，随后保存即可，结果见图15。