配对χ2检验(Paired χ2 Test)——jamovi软件实现

发布于 2022年12月31日 星期六 16:24:34 浏览:1360
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在前面文章中介绍了配对χ²检验(Paired χ2 Test)的假设检验理论,本篇文章将实例演示在jamovi软件中实现配对χ²检验的操作步骤。

关键词:jamovi; 配对四格表; 配对卡方检验; McNemar检验

一、案例介绍

某实验室分别用A方法和B方法对600名患者血清中某抗体进行测定,数据见图1。问两种方法的检测结果有无差别?

图1

二、问题分析

本案例的分析目的是比较两种方法的检测结果有无差别,属于配对设计,可以认为是在比较两种方法检测结果的一致性,或者比较两者阳性检测率的差异。每个数字代表的是一个对子,而不是单独的一个频数。对于本案例可采用2×2配对χ2检验(McNemar test)进行分析。但需要满足3个条件:

条件1:观察变量为二分类变量。本案例数据为检测结果的阴性和阳性,满足该条件。

条件2:试验方法或干预措施为两个。本案例为A和B两种检测方法,满足该条件。

条件3:研究设计为配对设计,即对同一批样本或研究对象进行两种方法的检测或干预。本案例对同一组患者使用两种抗体检测方法,为配对设计,满足该条件。

三、软件操作及结果解读

(一) 适用条件判断

根据研究设计,本案例数据满足条件1~条件3。

(二) 统计描述及推断

1. 软件操作

选择“分析”—“频数分析”—“配对样本McNemar检验”(图2)。

图2

将变量“A”“B”和“频数”选入右侧相应的变量框内,并勾选“χ2”“连续校正χ2”“精确对数比值比”“行”和“列”(图3)。

图3

2. 结果解读

(1) 统计描述

“列联表”(图4)中给出了A方法和B方法检测一致性的对子数和不一致的对子数,各自检测的阳/阴性频数和百分比。可知两种检验方法一致的有440对(同为阳性110对,同为阴性330对),不一致的有160对(A方法为阳性,B方法为阴性130对;A方法阴性,B方法阳性30对)。

图4
(2) 统计学推断

“McNemar检验”(图5)给出了配对χ2检验、连续校正的配对χ2检验及确切概率法的统计量、自由度和P值。由于本案例b+c=160>40,所以使用配对χ2检验的结果。可知,χ2=62.500,P<0.001,提示两种方法检出的阳性率差异有统计学意义,即两种检测方法结果不同。

图5

四、结论

本研究采用2×2 配对χ2检验评价A、B两种检测方法检测患者血清中某抗体阳性率的一致性。结果显示检测不一致的有160对(A方法为阳性,B方法为阴性130对;A方法阴性,B方法阳性30对);配对χ2检验分析发现,两种检测方法结果不同(χ2=62.500,P<0.001)。

五、知识小贴士

(一) 适用情形

临床研究中常见的需要使用配对χ2检验的设计包括:

一组研究对象干预前后的配对,如一组高血压患者使用降压药前后血压达标率的比较。

一组研究对象身体不同部位的配对,如两种治疗某皮肤病的药物分别用在同一组研究对象的左臂和右臂,进行疗效的比较。

条件配对,如在同一窝老鼠中选择性别和体重相同的2只作为一个对子,组成多个对子;再将每个对子中的2只老鼠随机分配到2个处理组中去,然后比较两种处理方法的效果。

同一批生物样本不同检测方法的配对,如同一批血液样本被分成2份,分别用两种方法检测HbsAg (乙肝表面抗原)。

(二) 方法选择

对于2×2配对四格表,定义四个格子分别为abcdad为结果一致的对子数,bc为结果不一致的对子数。需要根据b+c的大小,选择分析方法:当b+c≥40时,选择McNemar检验(2×2配对χ2检验);当20≤b+c<40时,选择校正McNemar检验;当b+c<20时,选择确切概率法。

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