GraphPad Prism纵列表统计分析——单样本t检验 (One Sample t-test)

发布于 2022年10月3日 星期一 21:21:00 浏览:4967
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在医学研究中,经常会探究某一样本均数与已知均数是否相同,如果该样本服从正态分布,则常用单样本t检验进行分析。通常可以使用GraphPad Prism软件行单样本t检验,但无法绘制相应图形。在前面文章中介绍了单样本t检验 (One Sample t-test)的假设检验理论,本文旨在介绍在GraphPad Prism中进行单样本t检验的步骤。

关键词: GraphPad Prism; 纵列表; 单样本t检验; t检验;

一、案例介绍

某医生测量了52名特殊作业成年男性工人的血红蛋白含量,假设已知正常成年男性血红蛋白含量均数为145g/L,试问特殊作业成年男性工人的血红蛋白含量是否与正常成年男性有差异?部分数据见图1。本案例数据可从“附件下载”处下载。

图1

二、问题分析

本案例的分析目的是判断研究对象的血红蛋白含量均值与已知血红蛋白含量均值145g/L之间是否有差异,即比较研究样本与已知均数是否相同。针对这种情况可以使用单样本t检验。但需要满足4个条件:

条件1:观察变量为连续变量。本研究中的血红蛋白为连续变量,该条件满足。

条件2:观察变量相互独立。本研究中各研究对象的观察变量都是独立的,不存在互相干扰的情况,该条件满足。

条件3:观察变量不存在显著的异常值,该条件需要通过软件分析后判断。

条件4:观察变量为正态(或近似正态)分布,该条件需要通过软件分析后判断。

三、软件操作及结果解读

(一) 数据读取

1. 数据录入

打开GraphPad Prism,在弹出的欢迎界面左侧New table & graph (新建表格或图片)中选择Column (纵列表),在Data table (数据表)选择Enter or import data into a new table (在新的数据表中写入数据),在Options (选项)中,选择Enter replicate values, stacked into columns (输入复制值,叠加成列),单击create(创建)数据表,如图2所示。

图2

如图3所示,在Group A列输入需要的数据,代表血红蛋白 (Hb)。

图3

2. 数据导入

用户也可以导入已有的数据,具体过程如下:

(1) 点击上方工具栏file(文件)中的import(导入)选项 (图4)

图4

(2) 在弹出的对话框的右下角先选择需要导入的数据存放格式 (图5),然后选择用户的目标文件,单击OK

图5

(3) 在随后弹出的对话框Import and Paste Special Choice (导入并粘贴特殊选项,图6)的Linking and embedding (联系和嵌入)中选择Insert data only (仅插入数据)

(4) 点击Import(导入)即可

图6

将数据表重命名为“单样本t检验” ,对数据命名有助于日后的文件管理。如有需要,用户可以在Info部分对实验时间、实验编号和项目名称等进行简单描述,或者单击工具栏Sheet选项中的图标,可以在各表单上添加悬浮笔记,记录需要的信息(图7)。

图7

(二) 数据分析

1. 适用条件判断

正态性判断:点击左侧导航栏Results (结果)下的New Analysis (新建分析),在弹出的对话框中选择Normality and Lognormality Tests (正态性以及对数正态性检验),在随后弹出的对话框中保持默认并点击OK,如图8、图9所示。

图8
图9

单击Results (结果)下的“Normality and Lognormality Tests (正态性以及对数正态性检验)”选项框,即可查看正态性检验结果,如图10所示。单击Graphs (图形)下的“Normal QQ plot (正态QQ图)”即可查看正态性检验产生的Q-Q图,以辅助正态性检验的判断,如图11所示。

由图10的“Shapiro-Wilk normality test (夏皮罗-威尔克正态性检验)”结果显示P=0.1789>0.1,提示数据服从正态分布;图11中Q-Q图上散点基本围绕对角线分布,也提示数据呈正态分布,说明该数据符合正态性。满足条件4。

图10
图11

异常值检测需借助其他软件, 详见单样本t检验(One Sample t-test)——SPSS软件实现。经分析后,该数据满足条件3,符合单样本t检验条件。

2. 统计描述及分析

点击左侧导航栏中的Results(结果)部分New Analysis (新建分析)或单击上方工具栏中的Analyze(分析)按钮,弹出Create New Analysis(创建新的分析)界面,选择Column analyses (纵列表分析)中的One sample t and Wilcoxon test (单样本t检验和Wilcoxon秩和检验),单击OK (图12),在随后弹出的参数界面中勾选One sample t test (单样本t检验),并在Hypothetical value (假设值)中填入已知均数145g/L,单击OK (图13)。

图12
图13

上述步骤后,左侧导航栏Graphs (图表)下会出现“One sample t test of 单样本t检验”的结果,单击即可查看单样本t检验分析详细结果,包括t值,P值等,如图14。

图14

3. 结果解读

某特殊作业成年男性人群的血红蛋白含量为128.3±17.6 g/L,与正常成年男性人群血红蛋白均值145 g/L的差值为16.69 (95%CI为-21.59~-11.79)。样本人群的血红蛋白含量平均值低于正常人群,差异有统计学意义(t=6.840,P<0.0001)。

其他更多设置,可以根据需要在相应部分进行操作。

End
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