GraphPad Prism XY表图形绘制—— 散点图

发布于 2022年4月15日 星期五 20:31:11 浏览:6391
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散点图是指在直角坐标系中,各个数据的分布图,可以表示变量之间的变化趋势,多用于相关分析判断变量之间有无线性关系,以及用于回归分析判断自变量和因变量之间有无依存关系。此外,散点图也可以分类展示不同点之间的关系,例如聚类分析结果。本文实例介绍在GraphPad Prism中绘制散点图的步骤。

关键词:GraphPad Prism; XY表; 散点图

一、案例介绍

研究儿童年龄与尿肌酐含量之间的关系,测量了20名儿童的年龄(岁)与尿肌酐水平(mmol/24h),试描述两变量之间的相互关系。数据见图1,本文案例可从“附件下载”处下载。

图1

二、问题分析

本案例的分析目的是描述两变量之间的相互关系,由于两变量均为计量资料,因此可以尝试使用散点图分析两者之间的关系。

三、软件操作及结果解读

(一) 数据读取

1. 数据录入

打开GraphPad Prism,在弹出的欢迎界面中,Data table (数据表)选择Enter or import data into a new table (在新的数据表中写入数据),在Options (选项)中,X选择Numbers (数字),Y选择Enter and plot a single Y value for each point (即每一行只输入一个Y值),单击create创建数据表,如图2所示。

图2

如图3所示,在X列和Y列分别输入需要的数据,这里X代表儿童年龄(岁),Y代表尿肌酐含量(mmol/24h)。

图3

2. 数据导入

用户也可以导入已有的数据,具体过程如下:

(1) 点击上方工具栏file中的import选项 (图4)

图4

(2) 在弹出的对话框的右下角先选择需要导入的数据存放格式 (图5),然后选择用户的目标文件,单击OK

图5

(3) 在随后弹出的对话框Import and Paste Special Choice (导入并粘贴特殊选项,图6)的Linking and embedding (联系和嵌入)中选择Insert data only (仅插入数据)

(4) 点击Import即可导入数据

图6

将数据表重命名为“儿童年龄与尿肌酐含量关系” (图7),对数据命名有助于日后的文件管理。如有需要,用户可以在Info部分对实验时间、实验编号和项目名称等进行简单描述,或者单击工具栏Sheet选项中的图标,可以在各表单上添加悬浮笔记,记录需要的信息。

图7

(二) 图形绘制

点击左侧导航栏中的Graphs (图片)下属的New Graph…(绘制新图),在弹出的Great New Graph (绘制新图)对话框中的Kind of Graph (图形种类)下选择XY图下的散点图,单击OK (图8),结果如图9所示。

图8
图9

单击选中图形中的标题、图例等,利用上方的Text工具栏可以对其字体、字号等进行修改 (图10)。

图10

(三) 图形美化

1. 散点的美化

(1) 颜色设置

① 在工具栏Change栏中,单击图标或者双击图形绘制区,就可以进入Format Graph (图表样式)界面的Appearance (外观)选项卡中

② 在Data set下拉列表中可以选择“年龄与尿肌酐关系:A:尿肌酐含量 (mmol/24h)” (如果有多组数据可以通过此方法选择其中一组数据进行编辑)

③ 勾选Show symbol (显示符号)复选框以显示图表中的符号,并单击Color属性的下拉按钮,进入取色面板

④ 单击取色面板底部的More color& transparency (更多颜色&透明度),可以选择更多颜色和调整图标透明度(图11)

图11

⑤ 单击Add to Custom Colors (添加到自定义颜色)按钮,可以将定义好的颜色添加到左下角的Custom (自定义)中

⑥ 选中该自定义颜色,单击OK即可设定颜色(图12)

图12
(2) 形状设置

在上一步单击OK后,回到Appearance (外观)选项卡中,Shape (形状)可以改变图标的形状,Size (尺寸)调整图标的大小(图13),可以自行选择需要的形状和大小。

图13

2. 图形坐标轴的美化

(1) 整体框架的设置

① 单击工具栏Change栏中的图标或双击坐标轴进入Format Axes (坐标轴格式)界面

② 在Frame and Origin (框架与起始)页面下,Shape,Size and Position (形状、尺寸和位置)中可以对图标的X轴和Y轴的长短进行定义,还可以调整X轴和Y轴与边缘的距离

③ 在Axes and Colors (轴线与颜色)下可以对X轴和Y轴的粗细、颜色进行调整,见图14

图14
(2) X、Y轴设置

先设置X轴:

① 单击Format Axes (坐标轴格式)中的X axis (X轴)选项,进入X坐标轴的设置。

② 取消勾选Automatically determine the range and interval (默认的范围和间距),便可以对X坐标轴进行编辑。

③ 在Range (范围)下可以设置X轴的范围,这里选择0-15的范围。

④ 在All ticks (所有刻度线)中,通过Tick direction (刻度线方向)下拉选项,选择刻度朝向;通过Tick length (刻度线长度)选择刻度线长度。

⑤ 在Regularly spaced ticks (常用间隔刻度线)中,Major ticks (主刻度线)可以设置主要刻度间隔,Minor ticks (次刻度线)可以设置次要刻度的间隔(图15)。

完成对X轴的设置后,可同样的方法设置Y轴。

图15

3. 添加网格线

若需要添加横向网格线,可以在Frame and Origin (框架与起始)页面下,Frame and Grid Line (框架和网格线)中进行设置。Frame style为框架样式,Major grid为主要网格,Minor Grid为次要网格。Thickness (线条粗细)和Style (线条类型)可以设置网格线的粗细以及样式,如图16所示设置,最终结果见图17。

图16
图17

其他更多设置,可以根据需要在相应部分进行操作。

End
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