GraphPad图表分类

发布于 2022年4月8日 星期五 20:21:53 浏览:3590
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关键词:GraphPad Prism; GraphPad图表组成; GraphPad图表分类

一、GraphPad Prism图表组成

在Graphs (图形)部分选择合适的图形后,会在工作区生成一个图形 (如图1),该图形主要有六部分:图标题、Y轴、Y轴标题、图形绘制区、X轴、X轴标题。

图1

二、GraphPad Prism图表分类

GraphPad Prism的图表分类主要有8种:XY (XY表)、Column (纵列表)、Grouped (行列分组表)、Contingency (列联表)、Survival (生存表)、Parts of whole (局部整体表)、Multiple variable (多变量表)和Nested (嵌套表)。

(一) XY表

XY表中,每组数据由X值和Y值组成,它们共同定义数据的二维结构。XY表既可以用于展示连续性数据(计量变量),也可以用于分类数据(二分类变量或多分类变量)。XY表可以绘制多种图形,如散点图、折线图、直方图、棒棒糖图等,是GraphPad软件中可绘制的图形种类最多的数据表。XY数据表的右侧引导界面主要有两个可选择的数据表(图2、3):“在新的数据表中输入或导入数据”和“使用软件自带数据”。

图2
图3

XY表可绘制的图形可分为3组共15种(图4):

1. 统计量图组

它是将数据转换成统计量来表示的。有5种,分别是:(a)带误差线的散点图; (b) 直线连接的带误差线的散点图; (c) 直线连接的误差线图; (d) 带误差线的柱状图; (e)带误差线的面积图。

2. 重复数据图组

是同一个X值对应多个重复列的Y值,形成X值相同的多个点。有5种图形类型,分别是:(f) 重复点图;(g) 直线连接的重复点图;(h) 中位数或平均值直线连接的重复点图;(i) 箱线图;(j) 悬浮柱状图。

3. 单数据图组

该类图是由单个X、Y值确定数据点。有5种图形类型,分别是:(k) 散点图;(l) 直线连接的散点图;(m) 折线图;(n) 柱状图;(o) 面积图。

图4

(二) Column (纵列表)

纵列表也称作一维分组表,其特征是只有一个分组变量,数据表中的每一列代表一个组别,且在行上没有分组。在纵列表中,每一列可有相互独立或相关的数据,可以展示每列数据的分布和统计量。最常见的绘图图形是散点图、柱状图、箱线图和小提琴图等。与XY表类似,纵列表的右侧引导页面也有两个可选择的数据表(图5):“在新的数据表中输入或导入数据”和“使用软件自带数据”。

图5

纵列表可绘制的图形样式有3组18种(图6):

1. Individual value (个体值)

这类图侧重于数据展示,将原始数据以散点的形式表示出来。可分为三类图,即:散点图、带柱形的散点图和前后图。

2. Box and violin (箱线图和小提琴图)

这类图侧重于展示数据的分布,将原始数据的分布或范围以箱图或小提琴图的形式展示出来。

3. Mean/median & error (均数/中位数和误差)

这类图侧重于展示每组数据的统计量,可展示每组数据的平均数、中位数、几何均数、误差等参数和统计量。

图6

(三) Grouped (行列分组表)

行列分组表也称作二维分组表,即行和列都是分组因素(每一列定义一个组别,每一行定义一个组别)。行列分组表的数据输入引导界面与上面的两个表类似(图7)。

图7

行列分组表由于有两个分组变量,因此可绘制的图形种类较多,共有5组45种可绘制的图形(图8)。

1. Individual value (个体值)

该类有7种图形,与纵列表相同,侧重于展示数据,将原始数据以散点或柱形图的形式展示。从左到右依次为交错散点图、分组散点图、带柱状图的交错散点图,带柱状图的分组散点图、叠印散点图、重复测量的配伍散点图和重复测量的配伍堆积散点图。

2.Summary data (数据汇总)

该类有14种图形,主要通过柱状图和符号图来整体展示数据的统计量。第一行从左到右依次为交错柱状图、分组柱状图、堆积柱状图,后三个为坐标轴转换;第二行从左到右依次为交错符号图、分组符号图、叠印符号图和直线连接的叠印符号图,后四个为坐标轴转换。

3.Heatmap (热图)

该类有8种图形,用不同的颜色变化来展示数据信息,可以直观的将数据值的大小以定义的颜色深浅表示出来。

4.Three-way (三因素方差分析)

该类有4种图形,从左到右依次为直线连接的统计量图、嵌套交错柱状图、嵌套叠印散点图和嵌套并列散点图。

5. Box and violin (箱线图和小提琴图)

该类有12种图形,可分为交错和分组的箱线图、小提琴图。

图8

(四) Contingency (列联表)

列联表将观察值按照两个变量或多个变量分类列出,是一种特殊的频数统计表,其不能展示计算后的统计量、小数或百分数。GraphPad软件可以输入任意行列的R×C列联表。其输入界面如图9所示。

图9

列联表可绘制6种图形(图10):与行列分组表中的交错、分组、堆积柱状图相似,不同之处在于,列联表图形不能展示误差线。

图10

(五) Survival (生存表)

生存表是为生存资料所设置的一类表格,主要用于生存分析和绘制生存曲线。数据输入界面如图11所示。

图11

生存表可绘制4种图形(图12):

图12 (a)及(e)所示的生存曲线为带误差线和删失标记的阶梯图,是最常用的生存曲线;(b)及(f)所示为不带误差线的直线连接的点图;(c)及(g)所示为带误差线的直线连接的点图;(d)及(h)所示为不带误差线但带删失标记的阶梯图。

图12

(六)Parts of whole (局部整体表)

局部整体表的操作页面简单,其主要用来绘制饼图。

局部整体表可绘制5种图形(图13),从左到右依次是饼图、圆环图、水平切片图、垂直切片图和百分比点图。

图13

(七)Multiple variable (多变量表)

多变量表的每一列代表一个变量,每一行代表一个个体或一次试验。它的数据结构与行列分组表类似,但多变量表不能设置子列。

多变量表的图形菜单中只有一种图形(图14),即气泡图(Bubble plot)。但GraphPad软件新增了主成分分析,可自动生成得分图、载荷图、碎石图、双标图和方差比例图。

图14

(八) Nested (嵌套表)

嵌套表主要用于处理嵌套数据的统计分析和绘图。嵌套表与纵列表类似,区别在于:纵列表的每一个子列代表一次重复,每一列堆叠在一起的数据表示重复多次测量;而嵌套表每一行代表一次重复,每一行的子列数据表示方法的重复使用。

嵌套表可绘制如下6种图形(图15),从左到右依次为散点图、点柱图(在散点图的基础上加上柱状图)、柱状图、高低图、箱线图、小提琴图。

图15
End
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