关键词:样本量计算; PASS; 生存分析; 单样本生存曲线; 单样本治疗模型检验的样本量计算
一、案例数据
某研究者欲开展一项研究,以比较新手术和传统手术对某恶性肿瘤的治疗效果,传统手术治疗后患者的中位生存时间为1.1年,治愈率为0.45,当前响应总体呈Weibull分布,其形状参数为1.54,期望风险比为0.6,治愈率为0.65,入组时间为1年,随访时间3年。进行单样本治疗模型检验,取双侧α=0.05、β=0.10,试估计该研究所需要的样本含量?
二、案例分析
已知传统手术治疗后患者的中位生存时间为1.1年,治愈率为0.45,期望风险比为0.6,治愈率为0.65,欲比较新手术和传统手术对某恶性肿瘤的治疗效果,估计所需样本量,宜采用单样本治疗模型检验,其样本量估算需要以下几个参数:
- 入组时间Ta和随访时间Tƒ
- 风险参数,即两组风险比或中位生存时间(年)
- 形状参数k
- 治愈率,包括传统手术治疗方法治愈率和新手术方法治愈率
- 检验水准α (常取0.01至0.1),本例取0.05
- 检验功效1-β (常取0.80或更高),本例取0.90
三、软件操作
(一) 方法选择
在左侧界面中依次选择“Procedures (程序)”—“Survival (生存分析)”—“One Survival Curve (单样本生存曲线)”—“One-Sample Cure Model Tests)(单样本治疗模型检验)”见图1。
(二) 参数设置
在“Design (设置)”模块中按以下参数设置相应选项(图2):
- Solve For:“Sample Size”表示本分析的目的是用于计算样本量。
- Test:“Alternative Hypothesis”指定备择假设的单双侧,本例选择“Two-Sided”双侧检验。
- Power and Alpha:Power为把握度,填0.90;Alpha为检验水准,填0.05。
- Sample Size:“Ta (Actual Time)”表示入组时间,可以为0或以上数值,本例为1;“Tƒ (Follow-Up Time)”表示随访时间,即受试者从入组到研究结束间的时间长度,本例为3。
- Cure Rates:“n0(Proportion Cured-Control)”表示对照组的治愈率π0,本例为0.45;“n (Proportion Cured-New)”表示处理组的治愈率π1,本例为0.65。
- Hazard Rates:“Input Type”使用哪一组参数来指定历史对照(λ0)和抽取样本的新组(λ1)的风险比(HR),在PASS软件有5种选择,“λ0,λ1 (Hazard Rates)”(两组风险率)、“λ0,HR (Hazard Rate,Hazard Ratio)(对照组风险率及两组风险比)”、“M0,M1 (Median Survivals)(两组中位生存时间)”、“M0,HR (Median Survival,Hazard Ratio)(对照组中位生存时间和两组风险比)”、“S0,S1(Proportions Surviving)(两组生存比例)”和“S0,HR(Proportion Surviving,Hazard Ratio)(对照组生存比例和两组风险比)”。本例选择“M0,HR (Median Survival,Hazard Ratio)”,M0 (Median Survival-Control)对照组中位生存时间M0为1.1;HR (Hazard Ratio-λ0/λ1)风险比为0.6。
- Shape of New and Historic Survival Distributions:“k(Weibull Shape Parameter)”设定Weibull分布形状参数,本例填“1.54”。
(三) 报告设置
在“Reports (结果报告)”模块中设置输出结果参数,可默认设置参数;点击“Calculate (计算)”。
四、结果及解释
图4列出了该研究设计的相关参数和样本量计算结果,可知计算的样本例数(N)为42。
图5“References (参考文献)”列出了该计算过程中参考的相关文献;“Report Definitions (报告定义)”列出了各个参数的具体解释;“Summary Statements (报告概述)”为整个分析报告的摘要。
图6为此次样本量估算整个过程的详细参数设置汇总。
五、结论
该案例为单样本治疗模型检验计算样本含量。比较新手术和传统手术对某恶性肿瘤的治疗效果,已知传统手术治疗后患者的中位生存时间为1.1年,治愈率为0.45。当前响应总体呈Weibull分布,其形状参数为1.54,期望风险比为0.6,治愈率为0.65,入组时间为1年,随访时间3年。取双侧α=0.05、β=0.10,则至少需要42例研究对象。