森林图绘制参数说明

发布于 2024年1月6日 星期六 22:16:55 浏览:412
原创不易,转载请注明来源,感谢!
附件下载:
1717306841-经典双森林图.zip 请勿重复点击,如无响应请耐心等待或稍后再试。

森林图绘制一试就会,此说明只备不时之需!以绘制经典双森林图为例。
· 软件描述:森林图使用梦特云统计平台“森林图绘制”模块(https://mengte.pro/forest_plot)绘制
· 软件引用:梦特医数通. (2024-05-01). 梦特云统计-森林图绘制. https://mengte.pro/forest_plot

一、数据格式要求

支持文件格式:.csv/.xls/.xlsx/.sav/.dta/.xpt/.sas7bdat/.txt

文件最大支持:5MB

建议使用excel将数据整理为图1或图2格式,其中图2为强烈推荐格式(将会节省许多后续绘图步骤)。数据格式要求更多内容详见森林图绘制页面“查看数据示例”(图3)。空格、小数位数等格式会严格按照excel中所设置绘制在最终图形中,需要事先在excel数据中设置好。对于P值的小数位数需要设置为文本格式,否则对于诸如0.030等末尾为0的数值,在森林图中末尾不会显示,而会显示为0.03。

图1
图2
图3

二、导入数据

森林图绘制小工具中“当前文件”页面下点击“点击上传”按钮(图4),导入数据。

图4

三、数据设置

(一)已选择组合

如果数据是图1格式,导入数据后,会在“当前文件”页面下“已选择组合”中显示“OR1(95%CI)”“OR2(95%CI)”(图5)。此时“OR1(95%CI)”“OR2(95%CI)”是读取的excel中第一行的结果。

图5

如果数据是图2格式,导入数据后,会在“当前文件”页面下“已选择组合”中显示图6结果,其中第二行显然是错误识别结果,因为我们希望显示点估计值和置信区间的下限及上限。此时需要删除该列数据,然后通过选择正确的“点估计列(如OR值)”“置信区间下限列”“置信区间上限列”,点击“新增组合”添加正确的识别结果,如图7所示。

图6
图7

(二)统计列名称

“统计列名称”表示根据点估计值和置信区间生成的统计列名称。留空则默认名称为Estimate,多个名称使用逗号分割,如:OR1(95%CI),OR2(95%CI)。

如果数据是图1格式,导入数据后,会在“当前文件”页面下“已选择组合”中显示“OR1(95%CI)”“OR2(95%CI)”(图5)。此时“OR1(95%CI)”“OR2(95%CI)”可以直接使用。如果要修改,可以在“统计列名称”输入其他名称,多个名称使用逗号分割。

如果数据是图2格式,自动识别的结果不能直接使用,需要重新命名。可以在“统计列名称”输入其他名称,多个名称使用逗号分割,如:OR1(95%CI),OR2(95%CI)。

(三)直接绘制列

可以选择想在森林图中显示的列变量,如果不选则默认全部列都绘制到森林图中,如果选择了部分变量,则未选择的变量将不会绘制到森林图中。

四、图像参数基本设置

(一)图片宽度(英寸)和图片高度/行间距

一般不需要手动设置,如果对图片高度和宽度有特殊需求,可手动设置。支持浮点数(1英寸 ≈ 2.54cm),留空则系统自动设置。

(二)X轴最小值和X轴最大值

表示X轴下方反应森林图横线的刻度数值的最小值和最大值。一般不需要手动设置,留空则系统自动设置。

(三)X轴刻度间隔

表示X轴下方反应森林图横线的刻度数值的间隔。一般不需要手动设置,留空则系统自动设置。

(四)参考线刻度

表示OR值、HR值等效应量的参考线,对于OR值、HR值一般取1,对于连续性变量效应量,如SMD等一般取0,也可能取其他具有特殊意义的某个数值。一般不需要手动设置,留空则系统自动设置。

(五)图像标题

可直接输入文字,显示图片标题。默认无标题。

(六)标题字体大小

默认为9。

(七)正文字体大小

除了标题以外的森林图中所有字体的大小,默认为4.5。

(八)森林图颜色

表示森林图上中心点和线段颜色,高级设置中可以分开设置中心点、线段颜色。可以通过选择调色盘上面的颜色进行设置,也可以直接输入颜色代码设置。多森林图用逗号分隔(例:#3B6295,#286CCB),其中#不可少(图8)。更多颜色参数设置模版详见经典单森林图配色方案参考说明经典组合森林图配色方案参考说明经典双森林图配色方案参考说明经典多森林图配色方案参考说明经典交互作用多森林图配色方案参考说明

(九)透明度

表示森林图上中心点和线段的透明度,默认为1(完全不透明)。

(十)多森林图排列方式

表示森林图上中心点和线段的排列方式,“上下排列”则所有线段均显示在一列,“左右排列”则不同模型绘制的森林图线段显示在不同列(多用于交互作用森林图,见三步绘制经典交互作用多森林图)。

五、图像参数高级设置

(一)DPI

设置图片像素,数值越大,像素越高。

(二)统计列小数点位数

用于设置森林图上除P值以为的所有数值变量的小数位数,默认为3。

(三)是否绘制底纹

用于设置森林图是否显示底纹,“否”则为白底。选择“是”,可以设置喜欢的底纹颜色。可以通过选择调色盘上面的颜色进行设置,也可以直接输入颜色代码设置。更多颜色参数设置模版详见经典单森林图配色方案参考说明经典组合森林图配色方案参考说明经典双森林图配色方案参考说明经典多森林图配色方案参考说明经典交互作用多森林图配色方案参考说明

(四)森林图列位置调整

用于设置线段具体显示在图上的哪一列,可以先生成图形再微调,如想线段显示在第7列,则输入7;如果是多列线段,则用逗号分隔,如“5,8”(图9)。

图9

(五)X轴刻度自定义

设置具体的数值,表示X轴下方反应森林图横线的刻度。默认自动设置。

(六)X轴下方箭头设置

“是否绘制X轴下方箭头”表示是否显示X轴下方箭头。“左箭头说明和右箭头说明”显示左箭头和右箭头的具体含义,可以输入文字显示,不输入则默认为左箭头表示Low Risk,右箭头表示High Risk。“箭头与X轴距离”默认为2,数值越大距离越远。

(七)中心点设置

“中心点样式”下拉菜单有多种形状的中心点供选择,“中心点大小”默认为1,“中心点颜色”可以通过选择调色盘上面的颜色进行设置,也可以直接输入颜色代码设置,多森林图用逗号分隔(例:#3B6295,#286CCB),其中#不可少。更多颜色参数设置模版详见经典单森林图配色方案参考说明经典组合森林图配色方案参考说明经典双森林图配色方案参考说明经典多森林图配色方案参考说明经典交互作用多森林图配色方案参考说明

(八)线段设置

“线段宽度”表示森林图上线段的粗细,默认为0.6。“误差棒长度”表示线段两端误差棒的长度,默认为0.6。“误差棒宽度”表示线段两端误差棒的粗细,默认为0.6。“线段颜色”可以通过选择调色盘上面的颜色进行设置,也可以直接输入颜色代码设置,多森林图用逗号分隔(例:#3B6295,#286CCB),其中#不可少。“参考线颜色”可以通过选择调色盘上面的颜色进行设置,也可以直接输入颜色代码设置。更多颜色参数设置模版详见经典单森林图配色方案参考说明经典组合森林图配色方案参考说明经典双森林图配色方案参考说明经典多森林图配色方案参考说明经典交互作用多森林图配色方案参考说明

六、图形下载

设置好上述参数后,点击页面右下角“生成森林图”。可在“生成结果”页面产生图形,可根据图形对参数进行微调。点击下方的“下载PNG图片”可得到PNG格式,点击“下载PDF文件”可得到高清文件。

End
文章目录 沉浸式阅读